我國科學家開發(fā)出葉綠體基因組綜合數據庫

科研 2022-10-17 17:02

葉綠體是植物將光能轉化為化學能的重要細胞器，具有獨立的基因組，隨著基因測序技術的發(fā)展，盡管已發(fā)布了海量的植物葉綠體基因組序列，但如何整合應用這些數據目前仍面臨數據命名標準不統(tǒng)一、數據信息不全以及較高經濟價值的物種尚未進行測序等問題。

近日，發(fā)表在《Plant Biotechnology Journal》上題為“Towards comprehensive integration and curation of chloroplast genomes”的研究中，中國科學院北京基因組研究所和中國中醫(yī)科學院中藥資源中心研究人員開發(fā)了迄今為止物種數量最多的葉綠體基因組綜合數據庫Chloroplast Genome Information Resource（CGIR）。該數據庫收錄了來自11,946個物種的19,388條葉綠體基因組序列，包括利用全國第四次中藥資源普查標本自測的718種未發(fā)表的葉綠體基因組序列，按照基因組、基因、微衛(wèi)星序列、DNA條形碼、DNA特征序列五個功能模塊對數據進行組織與管理。

CGIR數據庫通過自主測序、整合公開基因組資源和人工數據審編向用戶提供了目前最全面、物種數量最多的葉綠體基因組數據。經審編的物種分類、物種功能、基因名稱與序列、分子標記等保證了數據的高度可靠，對植物系統(tǒng)發(fā)育、物種鑒定、葉綠體基因工程的發(fā)展均具有重要意義。

論文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36069606/

注：此研究成果摘自《Plant Biotechnology Journal》，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。

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